肿瘤免疫治疗的核心是肿瘤抗原被呈递并激活T细胞,肿瘤抗原呈递的关键要素是HLA。
人群中HLA的分型具有高度异质性,而不同等位基因的HLA呈递的抗原也不相同。
肿瘤患者HLA的等位基因型分布若具有不同于健康人的分布特征,则HLA-I等位基因分布频率,可以为肿瘤疫苗设计、TCR-T靶点设计、免疫检查点抑制剂的耐药机制提供关键数据。
pMHC四聚体可用于判断肿瘤抗原特异性T细胞含量,HLA等位基因型特点是四聚体是否适用于患者的关键信息。
为了能够使研究人员快速确定HLA的适用性,我们整合多篇研究成果,发布HLA-I型等位基因在TCGA患者分布频率查询表,供肿瘤抗原发现、肿瘤疫苗设计、TCR-T靶点设计、其他免疫治疗药物等领域的工作可快速开展。
TCGA HLA-I等位基因分布频率
统计方法
样本人数9176名患者
使用的分析方法为:PolySolver, Optitype and snp2HLA
如果患者的HLA发生突变,该患者数据将被剔除
参考文献
MHC-I Genotype Restricts the Oncogenic Mutational LandscapeCell. 2017
MHC molecules: Immune editing shapes the cancer landscape.Nat Rev Immunol. 2017
Immunotherapy: Nice to see you – evolving MHC I-peptide presentation.Nat Rev Clin Oncol. 2018