《免疫靶点选择的难点，这个收集了188万种抗原的数据库可以解决了》一文中详细介绍了IEDB数据的基本框架。作为实践者，实验验证才是对查询成果举一反三的重要环节。因此，本文在此详细列举出验证的方法：
| 检测对象 | 实验类型 | 文献数量 |
| T细胞实验 | 结晶 | 189 |
| T细胞实验 | 生物活性实验 | 10023 |
| T细胞实验 | 结合实验(抗原与T细胞结合) | 2894 (其中pMHC多聚体-四聚体流式实验2773篇) |
| MHC-多肽实验 | 结晶 | 607 |
| MHC-多肽实验 | MHC-配体洗脱实验 | 674 |
| MHC-多肽实验 | MHC-配体结合实验 | 2410 |
以上实验中，与细胞、临床标本有关的实验主要是“T细胞实验”-“生物活性实验”、“T细胞实验”-“结合实验”，其余实验均以单个蛋白样本为主。
